Изучение ассоциации полиморфизма генов цитокинов и MHCII с предрасположенностью к заболеванию туберкулезом М.Л.Филипенко , Н.А. Синицына , Е.В. Брижатюк , С.Л. Нарышкина , В.А. Краснов
Изучение ассоциации полиморфизма генов цитокинов и MHCII с предрасположенностью к заболеванию туберкулезом М.Л.Филипенко , Н.А. Синицына , Е.В. Брижатюк , С.Л. Нарышкина , В.А. Краснов
НИБХ СО РАН; 2 НИИТуб МЗ РФ, Новосибирск
Несмотря на то, что значительная доля людей (30–50 %) инфицирована Mycobacterium tuberculosis, только 10 % из них заболевают клинически выраженной формой туберкулеза. В настоящее время ни у кого не вызывает сомнений, что заболеваемость и смертность от туберкулеза определяется не только числом введенных в организм бактерий и вирулентностью, но также и генетически обусловленными факторами организма хозяина. Среди них цитокины играют важную роль при формировании как первичного, так и адаптивного иммунного ответа на бактериальную инфекцию.
Целью данной работы являлось изучение возможности ассоциации заболевания туберкулезом с полиморфными вариантами генов IL-10, IL-1Ra и тандемного повтора в области DQB1 локуса. В ходе исследования ,были созданы две панели ДНК: «контрольная» (n = 97), полученная от здоровых людей, имеющих более чем двухлетний тесный кон такт с бактериовыделителями, и «экспериментальная» (n = 127), полученная от пациентов с клиническими проявлениями активного туберкулеза. Установлено наличие четырех аллелей длин ного тандемного повтора во втором интронегена IL1Ra (240,325, 410, 500 п.н.) в выборке населения г. Новосибирска. Показано достоверное уменьшение частоты встречаемости 2го аллеля (p < 0,01, оценку проводили с помощью Fкритерия Фишера) в выборке больных туберкулезом легких (0,00625) в сравнении с соответсвующими показателями в контрольной группе (0,057). Достоверных отличий между частотами других аллелей в данных группах не обнаружено. Для гена IL-10 исследовали одиночную замену G?A в 1087 позиции. Нами не было найдено достоверных различий между частотами встречаемости каждого аллеля данного полиморфизма в исследуемых группах. При исследовании полиморфизма тандемного повтора (TTTA)n, расположенного на расстоянии 33kb от DQB1 локуса, было показано наличие 7 аллелей в выборке г. Новосибирска. Их структура была определена секвенированием и оказалась более сложной, чем ее описывали ранее — (TTTTTTA)n(TTTA)m. Наблюдали достоверное увеличение частоты встречаемости 4го аллеля (TTTTTTA)2(TTTA)5 (p < 0,01, оценку проводили с помощью Fкритерия Фишера) в группе больных туберкулезом легких (0,41) в сравнении с аналогичными данными в контрольной группе (0,273) и достоверное уменьшение встречаемости 7го аллеля (TTTTTTA)1(TTTA)13 (p < 0,01) в группе больных туберкулезом (0,077) в сравнении с показателями в контроле (0,173). Достоверных отличий между частотами других ал лелей в данных группах не было обнаружено.