загрузка...
 
Полиморфизм кластера гена интерлейкина 1 у больных туберкулезом легких
Повернутись до змісту

Полиморфизм кластера гена интерлейкина 1 у больных туберкулезом легких

М.М. Имангулова, А.Р. Бикмаева, Э.К. Хуснутдинова

Институт биохимии и генетики Уфимского научного центра Российской академии наук, Уфа

Изучено распределение генотипов и аллелей полиморфных генов семейства Д1 (Д1В и ^А) у 158 пациентов с инфильтративным туберкулезом легких (ИТЛ) и 180 здоровых индивидов Башкортостана. Анализ 1/№^-полиморфизма гена ILRA выявил достоверные различия в распределении частот генотипов и аллелей между больными ИТЛ и контрольной группой (р < 0,0001). Частота генотипа *1/*1 у больных ИТЛ составила 82,9 % по сравнению с 61,6 % у здоровых индивидов ^ = 3,022, 95 %С1 1,76-5,20). При анализе +3954С/Т гена К1В различий между исследуемыми группами не обнаружено (%2 = 1,28, р = 0,564). Распределение частот генотипов -511С/Т гена К1В показало, что частота генотипа К1В*А2А2 у больных ИТЛ повышена почти в 2 раза (33,96 %) по сравнению с контролем (17,92 %) (р = 0,0002, OR = 2,76, 95 %С1 1,48-5,20). Проанализированы комбинации генотипов генов ШВ и ILRA. Среди больных достоверно чаще встречались носители гаплогрупп А, В и D ^ = 4,17, 95 %С1 1,13-18,17; OR = 12,89, 95%С1 0,99-6932,3; OR = 16,29, 95%С1 2,28-333,0), которые можно рассматривать как факторы повышенного риска развития ИТЛ. (Цитокины и воспаление. 2005. Т. 4, № 1. С. 36-41.)

Ключевые слова: туберкулез легких, интерлейкин 1, полиморфизм гена.

 

В настоящее время не вызывает сомнения то, что генетические факторы в значительной мере определяют восприимчивость организма к различным заболеваниям, в том числе и инфекционной природы. Так, подавляющее большинство инфицированных M. tuberculosis остаются вполне здоровыми благодаря имеющемуся у них протек- тивному иммунитету, и только у 5-10 % людей иммунный ответ оказывается неэффективным, в результате чего происходит реактивация латентно протекающей инфекции и развитие активных форм туберкулеза [14].

Контроль за M. tuberculosis осуществляется широким спектром иммунокомпетентных клеток и продуцируемых ими цитокинов. На данный момент накопилось достаточно фактов, свидетельствующих о том, что патологические отклонения иммунного ответа связаны с нарушениями в продукции цитокинов. Среди цитокинов, играющих важную роль в координации иммунологических реакций, значительное место отводится ^-1, являющемуся главным медиатором LPS-индуцированного воспаления в легких [4].

У больных легочным туберкулезом в мокроте и бронхоальвеолярном лаваже отмечена высокая концентрация ^-1, что подтверждает участие этого цитокина как в местном, так и в системном воспалении при туберкулезе легких [10].

Семейство ^-1 включает два агониста — ^-1а и ^-1р и их специфический антагонист ^-^а. ^-1а и ^-1р кодируются разными генами, но имеют гомологию в аминокислотной последовательности 26 % и обладают практически одинаковой биологической активностью [11]. ^-1 является индуцибельным белком, синтез которого начинается в ответ на внедрение микроорганизмов, таких как микобактерии, либо повреждение тканей и необходим для развития воспаления и осуществления всего комплекса защитных реакций, именуемых острофазовым ответом [3]. Важнейшие свойства ^-1 — стимуляция пролиферации преактивированных антигеном зрелых Т-лимфоцитов, увеличение продукции IL-2, IL-4, INFy и TNFa, а также стимуляция фагоцитоза.

Основными клетками-продуцентами и главным источником IL-1 в организме являются моноциты и макрофаги, а также Т- и В-лимфоци- ты, NK-клетки, клетки эндотелия и нейтрофи- лы. У человека IL-1 в является главной формой секреторного IL-1, а IL-1a находится преимущественно в виде мембранной формы [4].

IL-Ra был впервые выделен из культуральной среды стимулированных моноцитов и обладал способностью ингибировать действие IL-1 на лимфоциты и фибробласты путем блокирования связывания IL-1 с клеточными рецепторами. Результаты структурного анализа молекулы IL-1Ra, проведенные после клонирования гена и получения рекомбинантного белка, показали, что IL-1Ra имел такую же, как и IL-1 молекулярную массу, а аминокислотная последовательность была на

% гомологична IL-1 в и на 19 % — IL-1a [11]. Поэтому IL-1Ra может считаться одним из белков семейства IL-1. Изменения в его строении по сравнению с молекулами IL-1a и IL-1 в привели к утрате способности к проведению сигнала, но сохранили возможность высокоаффинного связывания с рецепторами. Именно это свойство и обуславливает уникальную для биологии цитокинов ситуацию — существование IL-Ra как естественного специфического ингибитора IL-1.

Гены, кодирующие IL-1P и IL-Ша, картированы на длинном плече хромосомы 2 в области q14. Известно два биаллельных полиморфизма в гене IL1B: в промоторной части в положении -511 (С-511Т) [6] и в 5-м экзоне (С3954Т) [7, 9], где аллели -511Т и +3954Т ассоциированы с более высокой продукцией цитокина.

В гене ILRA известен минисателлитный полиморфизм — вариабельность по числу 86-членных тандемных повторов (VNTR) во 2-м интроне, который предполагает существование пяти аллелей, каждому из которых соответствует определенное число повторов [9]. Наиболее часто встречаются аллель ILRA*1, содержащий 4 повтора (у 74 % населения), и аллель ILRA*2, содержащий 2 86-членных повтора (21 %). Оставшиеся же аллели встречаются менее чем в 5 % случаев. Вопрос

о    функциональной значимости данного полиморфизма остается открытым. Предполагается, что увеличение числа повторов ведет к повышению транскрипционной активности ILRA. Однако большинство исследований показало, что макрофаги, стимулированные гранулоцитарно-макро- фагальным колониестимулирующим фактором (GM-CSF) in vitro, продуцируют избыточное количество рецепторного антагониста IL-Ша и сниженное количество IL-1P, если являются носителями аллеля ILRA*2 [14]. Hurme et al. продемонстрировали, что аллель 2 ILRA также способствует повышению концентрации антагониста IL-Ша в плазме, но только в комбинации с аллелем

511Т гена IL1B [14]. В другом исследовании обнаружено, что моноциты — «носители» аллеля ILRA*2 способствуют увеличению продукции IL-1P in vitro, независимо от характера полиморфизма в гене IL1B [13]. Таким образом, разнообразные исследования противоречат друг другу. В некоторых работах продемонстрировано, что ILRA*2 ассоциирован с повышенным [13, 14], пониженным [15] и сходным [15] уровнем секреторного IL-Ша по сравнению с другими аллелями.

Хорошо известно, что почти 50 % европейской популяции являются носителями аллеля ILRA*2 гена ILRA [5]. Широкая распространенность данного аллеля среди популяций позволяет гетерозиготам *1/*2 быть наиболее устойчивыми к туберкулезу легких. Гомозиготы *2/*2, согласно Santtila S et al. [13], намного чаще подвергаются различным инфекционным и воспалительным заболеваниям.

Цель настоящего исследования — изучение распределения генотипов и аллелей генов IL1B и ILRA у больных инфильтративным туберкулезом легких (ИТЛ), а также анализ возможных ассоциаций генотипов этих генов с риском развития туберкулеза.

Материалы и методы

Материалом для исследования послужили образцы ДНК больных инфильтративным туберкулезом легких (158 человек различной этнической принадлежности —русские, татары и башкиры), находящихся на стационарном лечении в Городском туберкулезном диспансере г. Уфы. Диагноз ИТЛ ставился на основании данных клинико-лабораторного исследования и рентгенографии. В качестве контроля использовали ДНК 180 здоровых, не находящихся в родстве, жителей Республики Башкортостан, никогда не болевших туберкулезом и не состоящих на учете в диспансере, а также соответствующих по возрасту и этнической принадлежности.

ДНК выделяли из лимфоцитов периферической крови методом фенольно-хлороформной экстракции по стандартной методике [2].

Анализ полиморфных локусов генов ILRA и IL1B проводили с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР) в стандартных условиях на амплификаторе «Терцик». Варианты С-511Т, С3953Т гена IL1B и VNTR гена ILRA выявляли с использованием праймеров, описанных в работе [14]. ПЦР вариантов С-511Т и С3953Т проводили в следующем режиме: первый цикл: 94 °С, 4 мин, далее 28 циклов 94 °С — 56 °С — 72 °С по 45 сек; после окончания амплификации смесь инкубировали 5 мин при 72 °С. Полученные амплифицированные фрагменты обрабатывали рестриктазами Aval(С-511Т) и TaqЦС3953Т) (ООО «Сибэнзим», Новосибирск). Длина продуктов расщепления для Taql(С3953Т) составляла: при наличии сайта рестрикции (аллель С) — 135 и 114 пн, при отсутствии (аллель Т) — 249 пн. Для варианта С-511Т (Aval) при наличии сайта (аллель А1) — 190 и 114 пн, при отсутствии (аллель А2) — 304 пн.

 

 

 

 

 

 

 

Амплификацию фрагментов VNTR-варианта гена ILRA проводили при следующих температурных условиях: 4 мин —денатурация при 95 °С, затем проводили 27 циклов амплификации в режиме: 94 °С — 40 сек, 60 °С — 40 сек, 72 °С — 1 мин, после чего смесь инкубировали 5 мин при 72 °С. Распределение аллелей данного полиморфного минисателлита следующее: аллель 1 — 410 пн, 2 — 240 пн, 3 — 500 пн, 4 — 325 пн, 5 — 595 пн. Нами учитывались только первые два аллеля, в связи с редкой встречаемостью 3, 4 и 5 аллелей.

Продукты амплификации и рестрикции анализировали в 7%-ном полиакриламидном геле в 1 х TBE буфере. ДНК фрагменты идентифицировали в проходящем УФ-свете, после окрашивания бромистым этидием.

Соответствие наблюдаемых распределений частот генотипов теоретически ожидаемым по закону Харди-Вайнберга оценивали по критерию х2 с помощью программы RхC (RowsхColumns) [12].

Попарное сравнение частот аллелей и генотипов проводили с использованием точного двустороннего теста Фишера

в рамках программы Statistica для Windows, версия 5.0. Статистически значимыми считали различия при р<0,05.

Силу ассоциаций оценивали в значениях показателя соотношения шансов (odds ratio, OR) по формуле:

OR = (ad)/(bc),

где а и b — число лиц с наличием/отсутствием данного генотипа, соответственно, а с и d — число здоровых лиц с наличием/отсутствием данного генотипа [1].

Результаты и обсуждение

Распределение частот генотипов и аллелей гена ILRA (VNTR) у больных ИТЛ представлено в табл. 1. Анализ VNTR-полиморфизма выявил достоверные различия в распределении частот генотипов (х2 = 21,31, р < 0,0001) и аллелей (х2 = 23,15, р < 0,0001) между больными ИТЛ и контрольной группой. Частота гомозигот по генотипу *1/*1 у больных ИТЛ составляла 82,9 %, тогда как у здоровых индивидов частота данного генотипа достигала лишь 61,62 % (х2 = 17,89, р < 0,001). Величина показателя относительного риска у носителей *1/*1 генотипа составила 3,022 (95 % С1 — 1,76-5,20). Частота гетерозигот *1/*2 в выборке больных была более чем в 2 раза ниже по сравнению с контрольной группой (16,46 % и 31,89 %, соответственно). Кроме того, в группе контроля отмечено статистически достоверное увеличение частоты генотипа *2/*2, на долю которого приходилось 6,5 % по сравнению с больными ИТЛ, где частота данного генотипа достигала лишь 0,6 % (X2 = 6,48, р = 0,011). При сравнении частот аллелей видно, что у больных ИТЛ частота аллеля ILRA*1 существенно превосходит данный показатель в группе контроля (91,14 % и 77,57 %). Относительный риск составил 2,98 (95 % CI — 1,84-4,83), что говорит о возможном вкладе данного аллеля в структуру патогенеза ИТЛ.

Сравнение полученных результатов с опубликованными литературными данными показало, что VWTR-полиморфизм гена ILRA также ассоциирован с туберкулезом у больных из Гамбии

. Распределения частот генотипов *1/*2 гена ILRA существенно различались между группами больных (16,46 % у больных из Уфы и 2,7% у больных из Гамбии), в то же время, распределение частот генотипов *2/*2 между больными туберкулезом отличались незначительно (0,63 % и 0,5 %, соответственно). Как в нашем исследовании, так и в работе Bellamy R. et al. [5] наблюдается преобладание гетерозиготного генотипа *1/*2 в контрольных группах по сравнению с группами больных, что позволяет рассматривать данный генотип как маркер пониженного риска развития туберкулеза (OR = 0,42, 95 % CI — 0,24-0,73).

Анализ распределения частот генотипов и аллелей полиморфного маркера +3954C/T гена IL1B (табл. 2) не выявил статистически значимых различий между больными ИТЛ и контролем (X2 = 1,28, р = 0,564). Наиболее распространенным в обеих группах был генотип дикого типа СС, который встречался с частотой 58,4 % у больных ИТЛ и 64,3 % у здоровых индивидов.

При изучении распределения частот генотипов -511C/T полиморфизма гена IL1B (см. табл. 2) обнаружены статистически достоверные различия между больными ИТЛ и здоровыми донорами (X2 = 17,75, р < 0,0001). Причем у больных ИТЛ наблюдалось значительное повышение частоты редкого генотипа IL1B*A2A2 (33,96 % по сравнению с 17,92% в контрольной группе; X2 = 6,66, р = 0,0106). Частота гомозигот дикого типа IL1B*A1A1 у больных туберкулезом была значительно ниже, чем у здоровых доноров (8,2 % и 25,5 %, соответственно). Величина относительного риска для носителей редкого генотипа IL1B*A2A2 составила 2,27 (95 %CI —1,20-4,31).

Анализ распределения частот аллелей промоторного полиморфизма

Таблица 2

Распределение частот генотипов двух полиморфных локусов гена К1В +3954С/Т и -511С/Т у больных ИТЛ и в контрольной группе

Аллель

ИТЛ

Контроль

X2 , Р

+3954C/T

CC

90

115

1,279

 

(58,44)

(64,25)

0,5644

CT

59

58

 

 

(38,31)

(32,40)

 

TT

5

6

 

 

(3,25)

(3,35)

 

С

239

288

0,814

 

(77,59)

(80,45)

0,390

Т

69

70

 

 

(22,40)

(19,55)

 

-511C/T

А1А1

13

27

17,753

 

(8,18)

(25,47)

0,0000

А1А2

92

60

 

 

(57,86)

(56,60)

 

А2А2

52

19

 

 

(33,96)

(17,92)

 

А1

118

114

13,46

 

(37,58)

(53,77)

0,0002

А2

196

98

 

 

(62,42)

(46,23)

 

T

/

C

1

1

5

1

показал

повышение аллеля

IL1B*A2 в

группе больных ИТЛ (62,4 %) по сравнению с контрольной группой (46,2 %), за счет значительного снижения доли аллеля II1В*А1 (37,6 %). Таким об-

 

разом, риск развития ИТЛ у носителей аллеля IL1B*A2 был повышен почти в 2 раза (OR = 1,93, 95 %CI— 1,34-2,80). Похожие результаты были получены при исследовании идиопатического легочного фиброза в Чехии [9]. В то же время, полученные результаты не согласуются с работой Bellamy R. et al. [5], в которой не обнаружено достоверных различий в распределение частот генотипов —511C/T гена IL1B у больных туберкулезом из Гамбии.

Поскольку белковые продукты генов IL1B и ILRA являются естественными антагонистами, то рациональным представлялось проведение анализа сочетаний генотипов с риском развития ИТЛ (табл. 3). При сочетании генотипов по VNTR-аллелю гена ILRA и —511C/T гена IL1B обнаружено, что среди больных ИТЛ значительно чаще встречались индивиды с гаплогруппой *I/*I — А1А1 (30,49 % против 8,82 % в контроле; X2 = 15,27, р < 0,001). Носители данной гаплогруппы имеют достаточно высокий риск развития туберкулеза легких (OR = 4,53, 95 %CI — 1,99-10,62). Гаплогруппы *1 /*2 — А1А2 и *1/*2 — А2А2 достоверно чаще встречались среди здоровых доноров (X2 = 6,44, р = 0,012; X2 = 5,16, р = 0,02), что можно рассматривать как маркеры пониженного риска (OR = 0,40, 95 %CI — 0,19-0,83 и OR = 0,24, 95 %CI — 0,06-0,85, соответственно).

Анализ распределения частот генотипов ILRA(VNTR) — IL1B( + 3954C/T) показал, что среди больных достоверно чаще встречалось сочетание *I/*1 — СТ (X2 = 4,303, р = 0,038). У индивидов с данной комбинацией генотипов риск развития ИТЛ оказался повышен почти в 2 раза

 

 

 

 

Гаплогруппа

ILRA — IL1B(-511C/T)

ИТЛ

Контроль

p

Гаплогруппа

ILRA — IL1B(+3954C/T)

ИТЛ

Контроль

p

*1/*1 — А1А1

43

9

0,000

*1/*1 — CC

69

70

0,45

 

(30,49)

(8,82)

 

 

(47,59)

(51,09)

 

*1/*1 — А1А2

64

38

0,26

*1/*1 — CT

44

32

0,038

 

(45,39)

(37,25)

 

 

(30,34)

(23,36)

 

*1/*1 — А2А2

7

10

0,23

*1/*1 — TT

5

4

0,852

 

(4,96)

(9,80)

 

 

(3,45)

(2,92)

 

*1/*2 — А1А1

5

3

1,000

*1/*2 — CC

13

29

0,034

 

(3,55)

(2,94)

 

 

(8,97)

(21,17)

 

*1/*2 — А1А2

17

26

0,012

*1/*2 — CT

13

19

0,571

 

(12,06)

(25,49)

 

 

(8,97)

(13,87)

 

*1/*2 — А2А2

4

11

0,02

*1/*2 — TT

0

0

 

 

(2,84)

(10,78)

 

 

0

0

 

*2/*2 — А1А1

00

2

0,34

*2/*2 — CC

1

9

0,039

 

 

(1,96)

 

 

(0,69)

(6,57)

 

*2/*2 — А1А2

1

1

1,000

*2/*2 — CT

0

1

1,000

 

(0,71)

(0,98)

 

 

0

(0,73)

 

*2/*2 — А2А2

00

2

0,34

*2/*2 — TT

0

0

 

 

 

(1,96)

 

 

0

0

 

Таблица 3

 

 

 

 

(OR = 1,79, 95 %С1 — 1,03-3,14). Гаплогруппы *1/*2 — СС и *2/*2 — СС маркируют пониженный риск развития ИТЛ (OR = 0,46, 95 %С1 — 0,21-0,97 и OR = 0,12, 95 %С1 — 0,006-0,937, соответственно).

Анализ сочетания трех генотипов ILRA(VNTR) — ^1В-511С/Т — ^1В + 3954С/Т представлен в табл. 4. Среди больных достоверно чаще встречались носители гаплогрупп D и В (%2 = 11,17, р = 0,0016 и X2 = 4,55, р = 0,0331, соответственно). Относительный риск для гаплогруппы D достиг 16,3 (95 %С1 — 2,28-333,0) и 12,9 (95 %С1 — 0,996932,3) для гаплогруппы В, следовательно, эти комбинации генотипов могут выступать как маркеры повышенного риска развития ИТЛ. Также в

Таблица 4

Комбинации — К1В-511С/Т — К1В+3954С/Г генотипов полиморфных локусов генов ILRA и К1В у больных ИТЛ и в контроле

Гаплогруппа

VNTR — C511T — C3954T

ИТЛ

Контроль

р

А

*1/*1 — А1А1 —

СС

25

(18,52)

3

(3,70)

0,029

B

*1/*1 — А1А1 —

СТ

13

(9,63)

0

0,033

C

*1/*1 — А1А1 —

ТТ

3

(2,22)

1

(1,23)

1,000

D

*1/*1 — А1А2 —

СС

30

(22,22)

1

(1,23)

0,002

E

*1/*1 — А1А2 —

СТ

7

(5,19)

1

(1,23)

0,477

F

*1/*1 — А1А2 —

ТТ

29

(21,48)

12

(14,82)

1,000

G

*1/*1 — А2А2 —

СС

0

1

(1,23)

0,663

H

*1/*1 — А2А2 —

СТ

2

(1,48)

2

(2,47)

0,743

K

*1/*2 — А1А1 —

СС

2

(1,48)

2

(2,47)

0,743

L

*1/*2 — А1А1 —

СТ

3

(2,22)

1

(1,23)

1,000

M

*1/*2 — А1А2 —

СС

8

(5,93)

13

(16,05)

0,003

N

*1/*2 — А1А2 —

СТ

9

(6,66)

7

(8,64)

0,336

P

*1/*2 — А2А2 —

СС

2

(1,48)

7

(8,64)

0,006

Q

*1/*2 — А2А2 —

СТ

1

(0,74)

3

(3,70)

0,153

R

*2/*2 — А1А1 —

СТ

0

1

(1,23)

0,663

S

*2/*2 — А1А2 —

СС

1

(0,74)

1

(1,23)

1,000

T

*2/*2 — А2А2 —

СС

0

2

(2,47)

0,164

Примечание. Гаплогруппы обозначены буквами латинского алфавита. В таблице представлены только встречавшиеся гаплогруппы.

 

группе больных встречались индивиды с сочетанием нормальных генотипов по полиморфным ло- кусам —511C/T и +3954C/T гена IL1B и генотипа *I/*I гена ILRA (гаплогруппа А) (18,52 % против 3,70 % в контроле; %2 = 4,800, p < 0,05). У носителей гаплогруппы А риск развития ИТЛ оказался повышен в 4 раза (OR = 4,17, 95 %CI — 1,13-18,17). Гаплогруппы М и Р являются маркерами пониженного риска развития ИТЛ (OR = 0,22, 95 %CI —

077-0,610 и OR = 0,11, 95 %CI — 0,016-0,604, соответственно).

Таким образом, тяжесть воспалительного процесса при туберкулезе, наряду с вирулентностью M. tuberculosis, определяется балансом провоспалительных и антивоспалительных ци- токинов, продуцируемых различными клетками иммунной системы. IL-1 в — один из главных медиаторов воспаления, провоспалительные свойства которого уравновешиваются внутриклеточным IL-1Ra. Поскольку IL-1Ra и IL-1 в являются естественными антагонистами и конкурируют друг с другом за связывание с одними и теми же клеточными рецепторами, то не столько изменение синтеза каждого в отдельности, сколько соотношение IL-1Ra/IL-1p имеет значение, влияя на исход воспалительного заболевания. Так, нами обнаружено, что гаплогруппы А, В и D (см. табл. 4) являются факторами риска развития туберкулеза легких, что, по всей вероятности, связано с гиперпродукцией секреторного IL-1Ra, которая вызвана высокой транскрипционной активностью гена ILRA*1, при нормальной экспрессии IL-1 р. Наши данные согласуются с работой Opal S.M. et al. [11], согласно которой чрезмерный избыток IL-1Ra способствует повышенной чувствительности организма к различным патогенам, включая M. tuberculosis. В то же время, носители гап- логрупп М и Р значительно меньше подвержены риску развитию туберкулеза легких. Вероятно, это связано с тем, что избыточная продукция IL-1Ra нейтрализуется повышенной продукцией IL-1р, ассоциированной с высокой экспрессией гена IL1B.

Следовательно, можно предположить, что дисбаланс между IL-1Ra и IL-10 нарушает процесс стимуляции пролиферации Т-лимфоцитов, способствует деструктивным процессам в легких и, тем самым, содействует прогрессии туберкулеза.

Таким образом, в нашей работе проведен анализ полиморфных локусов генов IL1B(-511C/T и +3954C/T) и ILRA(VNTR), а также впервые выявлены сочетания генотипов этих генов, возможно повышающие риск развития туберкулеза легких. Полученные результаты комбинаций генотипов генов ILRA и IL1B также показывают, что кластер гена IL1 вносит существенный вклад в чувствительность организма к туберкулезу легких.

 

 

 


ЛИТЕРАТУРА

 

 

 

Животовский Л.А. Популяционная биометрия. — М.: Наука, 1991. — 298 с.

Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Дж. Методы генетической инженерии. Молекулярное клонирование. — М.: Мир, 1984. — 399 с.

Ройт А., Бростофф Дж., Мейл Д. Иммунология. — М.: Мир, 2000. — 592 с.

Симбирцев А. С. Биология семейства интерлейкина-1 человека // Иммунология — 1998. — № 3 — С. 9-16.

Bellamy R., Ruwende C., Corrah T. et al. Assessment of the interleukin 1 gene cluster and other candidate gene polymorphisms in host susceptibility to tuberculosis // Tuber. Lung Dis. — 1998. — Vol. 79, № 2. — P. 83-89.

de Giovine F.S., Takhsh E., Blakemore A. J., Duff G. W. Single base polymorphism at -511 in human interleukin -1b gene // Hum. Mol. Genet. — 1992. — Vol. 1. — P. 450-457.

Dominici R., Malferrari G. The Interleukin 1b exonic (+3953) polymorphism does not alter in vitro protein secretion // Exp. Mol. Pathol. — 2002. — Vol. 73. — P. 139-141.

Hurme M., Santtila S. IL-1 receptor antagonist (IL-1RA) plasma levels are coordinately regulated by both IL-1RA and IL-1-b genes // Eur. J. Immunol. — 1998. — Vol. 28. — P. 2598-2602.

Hutyrova B., Pantelidis P., Drabek J. et al. Interleukin-1 gene cluster polymorphisms in sarcoidosis and idiopathic pulmonary fibrosis // Am. J. Respir. Crit. Care Med. — 2002. — Vol. 165, № 2. — P. 148-151.

Juffermans N., Verbon A., Belisle J.T. et al. Mycobacterial lipoarabinomannan induces an inflammatory response in the mouse lung // Am. J. Respir. Crit. Care Med. — 2000. — Vol. 162, 2 Pt. 1. — P. 486-489.

Opal S.M., DePalo V.A. Anti-inflammatory cytokines // Chest. — 2000. — Vol. 117, № 4. — P. 1162-1172.

Roff P.A., Bentzen P. The statistical analysis of mtDNA polymorphism chi 2 and problem of small samples // Mol. Biol. Evol. — 1989. — Vol. 6. — P. 539-545.

Santtila S., Savinainen K., Hurme M. Presence of the IL-1RA allele 2 (IL-1RN*2) is associated with enhanced IL-1b production in vitro // Scand. J. Immunol. —

— Vol. 47. — P. 195-198.

Wilkinson R. J., Patel P., Llewelyn M. et al. Influence of polymorphism in the genes of interleukin-1 receptor antagonist and IL-1b on tuberculosis // J. Exp. Med. — 1999. — Vol. 189, № 12. — P. 1863-1874.

Witkin S., Gerber S., Ledger W.J. Influence of interleukin-1 receptor antagonist gene polymorphism on disease // Clin. Infect. Dis. — 2002. — Vol. 34, № 2. — P. 204-209.

 

 

 

 

Interleukin 1 gene cluster polymorphisms in patients with pulmonary tuberculosis

M.M. Imangulova, A.R. Bikmaeva, E.K. Khusnutdinova Institute of Biochemistry and Genetics, Ufa Research Center, Russian Academy of Sciences, Ufa

The distribution of allele and genotype frequencies of the IL-1 family genes (IL1B and IL1RA) was studied in 158 patients with pulmonary tuberculosis and in 180 healthy individuals from Bashkortostan. Analysis of the VNTR polymorphisms of the IL1RA gene revealed statistically significant difference between patients with tuberculosis and control subjects (p < 0,0001). The frequency of the *1/*1 genotype was 82,9 % in tuberculosis patients compared to 61,6 % in healthy individuals (OR = 3,022, 95%CI — 1,76-5,20). Analysis of the IL1B+3954C/T showed no difference between the examined groups (x2= 1,28, p = 0,564). Analysis of the IL1B-511C/T showed that in patients with pulmonary tuberculosis, the frequency of the IL1B*A2A2 genotype was significantly higher than in the control group (p < 0,001, OR = 2,76, 95%CI — 1,48-5,20). Genotype combinations of the IL1B and the IL1RA genes were characterized. In the group of tuberculosis patients, haplogroups of A, B and D were more frequent (OR = 4,17, 95%CI — 1,13-18,17; OR = 12,89, 95%CI — 0,99-6932,3: OR = 16,29, 95%CI — 2,28-333,0). These results indicated that haplogroups of A, B and D could be risk factors for tuberculosis. (Cytokines and Inflammation. 2005. Vol. 4, № 1. P. 36-41.)

Key words: pulmonary tuberculosis, interleukin-1, gene polymorphism.

Государственное учреждение Научно-исследовательский институт клинической иммунологии Сибирского отделения Российской академии медицинских наук

630099, г. Новосибирск, ул. Ядринцевская, 14 Телефон (3832) 22-26-74, факс (3832) 22-70-28



загрузка...