Лікворний тиск нормальний. Кількість лейкоцитів нормальна, рідко буває збільшеною (5-15?106/л). Зазвичай спостерігається легка гіперпротеїнрахія (0,5-0,8 г/л) із незначним збільшенням рівня ?-глобулінів і головним чином IgG. При диференціюванні переважають Т-лімфоцити. Вміст глутаміну і гомованіліну зменшений.
Як правило, спостерігається інтратекальний синтез моноклональних антитіл. Кількість норадреналіну збільшена в ЦСР сильніше при більш тяжких формах, а ГАМК і ГВК – зменшена. Характерним для БАС є низькі рівні циклічних нуклеотидів, особливо цГМФ. Це пов'язано з підвищеним їх розпадом. При БАС зменшено синтез і вивільнення циклічних нуклеотидів із ЦНС, а не підвищено їх розпад у лікворі.
Унаслідок порушення балансу між утворенням ліквору і резорбцією його тиск підвищений. Проте він може бути нормальним усупереч збільшенню об'єму ЦСР. Кількість клітин у межах норми. Кількість білка також нормальна або дещо збільшена (0,50-0,70 г/л – при гідроцефалії). Протеїнограма показує зменшення рівня преальбумінів і збільшення глобулінів.
Зміни в системі протеїнів пов'язані з порушенням проникності ГЕБ і утрудненням резорбції лікворних білків у результаті порушення циркуляції. Встановлено збільшення кількості преальбуміну і трансферину при нормальному загальному білку. Вміст моноамінів у ЦСР збільшується в результаті зменшення абсорбції, особливо ГВК і 5-ГІОК. Установлено підвищення рівня мієліносновного протеїну.